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牡丹病毒病
症状:牡丹环斑病毒（PRV）在叶片上产生深绿和浅绿相同的同心轮纹圆斑，同时有小的坏死斑，植株不矮化，TRV亦变化大小不一的环斑或轮斑，有时则呈不规则形，而PLCV引起植株明显矮化，下部枝条细弱扭曲，叶黄化卷曲。
病原物:
（1）牡丹环斑病毒（Peonyringspotvirus,PRV）病毒粒体球状，27纳米。难以汁液摩擦接种，可以由蚜虫传播。
（2）烟草脆裂病毒（Tobaccorattlevirus
TRV）病毒粒体有两种，长的为190纳米，短的为45~115纳米。能汁液接种，报道线虫、菟丝子和牡丹种子都能传毒。
（3）牡丹曲叶病毒(Peonyleafcurlvirus,PLCV)由嫁接传染。
传染途径:用病株分株养殖，或作嫁接材料以及田间蚜虫大量发生。寄主植物：PRV、PLCV为害芍药、牡丹；TRV除芍药、牡丹外，还为害风信子、水仙、郁金香等花卉。
牡丹白粉病
症状：叶片上产生白色粉霉斑，常扩大接连成片，甚至覆盖整株叶片和茎杆，引起植株早衰或枯死。
病原物：ErysipheaquilegiaeDC.etMer.,称耧斗花白粉菌。
传播途径：病菌以闭囊壳（病叶上小黑点）在病残体上越冬，产生子囊孢子，引起初侵染。以分生孢子不断进行再侵染。
防治方法
1、加强栽培管理
施氮肥不宜过多，应适当增施钾、钙肥，以增强植株长势，提高抗病力。适时修剪整形，去掉病梢、病叶，改善植株间通风、透光条件。室内盆栽时，应置于通风良好、光照充足之处。冬季要控制室内温湿度，夜间要注意通气。秋末冬初移入温室（或冷窖）前，应仔细检查，发现病叶、病梢立即剪除并烧毁，以免带入室内传播蔓延。
2、药剂防治
发病初期喷洒15％粉锈宁可湿性粉剂1000倍液，或70％甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，均有良好的防治效果。粉锈宁的残效期可达20~25天，喷药后受病害部位的白层暗灰色，干缩并消失。
牡丹褐斑病
牡丹褐斑病在牡丹生育后期发生。
症状:叶表面出现大小不同的苍白色斑点，一般直径为3－7毫米大小的圆斑。一叶中少时1~2个病斑，多时可达30个病斑。病斑中部逐渐变褐色，正面散生十分细小黑点，放大镜下绒毛状，具数层同心轮纹。相邻病斑合并时形成不规则的大型病斑。发生严重时整个叶面全变为病斑而枯死。叶背面斑病呈暗褐色，轮纹不明显。
病原:病原菌为变色尾孢菌（Cercosporavariicolor Winter）.