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君子兰腐烂病在幼龄及成植株上都有发生，轻者只有几片叶或几条根腐烂，重者全部叶片烂掉，小苗可整株死亡，如防治不及时，肉质亘根也会全部烂掉。引起发病的原因，一是由于机械损伤、肥料烧伤，造成伤口，招致病菌感染，产生腐烂；二是由于管理不善，湿度过大，或温湿度变化过大而引起。在管理上应注意养护，应将溃烂组织切除后涂以木炭粉或细炉灰，或浸入0.1%高锰酸钾中5分钟，然后用清水冲洗，阴干。
君子兰是肉质根，由于养护不当等原因，易引起根部腐烂。造成君子兰烂根的原因很多：（1）施用末腐熟的有机肥或施肥过多，或肥料直接触及根系，根被烧坏引起烂根；（2）浇水不当，尤其是在夏季高温、冬季低温的情况下，浇水过量，极易烂根；（3）培养土配制比例不当，造成盆土板结，盆内长期积水。此外，君子兰分株时分割处末消毒，细菌侵染等，也易造成烂根。
防治方法：使用充分腐熟的有机肥，不要接触根系；盆土以透气性好、渗水性强、土质微酸性为好，常用森林腐殖土，南方一些地方可用塘泥、山泥、碎砖石加木炭等。君子兰有发达的肉质根，能贮存较多的水分，并有一定的耐旱性，浇水以少量为好，以经常保持湿润为宜；发现君子兰烂根后立即将植株从盆内移出，轻轻剥去泥土，用清水把根冲洗干净。再用洁净的利剪，把烂根剪掉，再用洁净的利剪，把烂根剪掉，然后把根浸入0.1%高锰酸钾液中消毒，取出后蘸少许硫磺粉或草木炭，放在阴处晾干。如烂根严重的需把它栽植在经过用开水消毒的沙土里，促发新根。如烂根较少的可换上新的培养土，重新上盆。上盆后适当控制浇水，放在半阴处养护，萌发出新根后再转入正常水肥管理。
兰花腐烂病
此病多在气候湿润的夏秋多雨季节发生，常见的有黑腐病、软腐病等。
黑腐病：由疫霉属真菌引起。多发生在叶片、根部和生长点，病部最初出现半透明的斑点，继而斑点扩大，组织发黑腐烂。
软腐病：由欧文氏杆菌属和假单孢杆菌属细菌引起。发病初期，叶片上出现微小的褐色水浸状斑，随后扩大成灰色、潮湿的斑块，稍一触压表皮就会破裂，并流出有恶臭味的菌脓。
防治方法：首先要保持植株通风，降低湿度，发病初期用50%克菌丹500倍液、50%退菌特1000倍液、大蒜水（将大蒜捣碎浸水、取其滤液）喷洒叶面或涂抹病斑。
兰花烂根
兰花虽喜湿润，但它的肉质根系却怕涝，过湿或雨淋积水容易烂根，并易诱发黑斑病。所以养兰的盆土平时不宜过湿。冬季兰花处于休眠或缓慢生长阶段，盆土宜偏干；春、初夏是兰花生根抽叶生长的重要时期，盆土宜偏干；春、初夏是兰花生根抽叶生长的重要时期，盆土宜偏润；但长期过湿，也易造成烂根，引起叶片枯黄甚至死亡。因为水分过量，造成土壤积水，透气性差，致使氧气不足，阻碍根部呼吸作用，引起根系变黑腐烂。梅雨或暴雨季节盆栽兰花必须避雨，因久雨多湿，新叶上最易发生黑斑点，而且花蕊常有“烂衣”现象，影响开花和观赏。但是，盆土过干，易使假鳞茎干瘪或其他组织因失水而影响代谢作用，也会导致组织纤弱，植株生长不良，乃至死亡。但秋季宜适当偏湿，因为秋季干旱会对来年抽叶开花有不利的影响。故养兰者应懂得“冬不湿、秋不干”的诀窍。
以上说明兰花在不同时间对水分（包括湿度）有不同的要求，因此应严格掌握兰花浇水量。兰花施肥不当，如施肥过多、过浓，将液肥灌入叶鞘或溅到叶片上也易引起根系腐烂，因此施肥时要沿着盆沿施。
郁金香鳞茎腐烂
郁金香出现鳞茎腐烂，原因为以下几个方面：掘出的鳞茎，没有晾干并附有带病菌的泥土，贮藏期间温度高、湿度大，适宜病菌蔓延，造成鳞茎腐烂；栽培时使用带病菌（多为镰刀菌）的土壤和未经充分腐熟的肥料，遭受病菌为害，造成鳞茎腐烂；盆土为粘性土，加上浇水过多，造成盆土积水，引起鳞茎受涝腐烂；掘起球根时间过早，新的鳞茎生长得不充实，也容易造成腐烂。防止鳞茎腐烂，要针对上述发病因素，分别采用对应措施。
仙客来块茎腐烂
栽养仙客来，夏季块茎容易腐烂，这主要是由于养护不当造成的。夏季天气炎热而通风不良或是淋了雨水，均易引起块茎腐烂。仙客来喜湿润，但怕涝，若浇水过多，使盆土中的水分经常处于饱和状态，则块茎及根长时间处于窒息状态，根压降低，吸收活力减退，植株衰弱，嫌气细菌活跃，产生有毒气体，因而也能导致块茎腐烂，此外，施液肥时，不慎淹没块茎项部，也易引起腐烂。显然，防止仙客来块茎腐烂的方法是防水涝和高温。
茉莉茎腐病
此病发生在茎基部。病斑初为褐色小斑，水渍状。然后纵向扩展成条斑状，边缘暗褐色，内灰褐色，后期病斑组织纵裂，并出现黑色粒状物，即病原菌的分生孢子器。该病菌存活在寄主植物病残体上。在温室内养护可常年发病，尤其是早春发病更为严重。室外养护时8月-9月也有发生。高温潮湿条件有利于病害的发生。
防治方法：及时剪除死株，集中烧毁。花卉上盆时喷洒0.2-0.4度石硫合剂。发病后也可选用3度石硫合剂或70%托布津500-1000倍液或50%福美双500倍液涂病斑。